エクソーム解析

エクソン領域を限定して回収・シーケンスすることで、低コストに大量のデータ取得が可能です。

サービス概要

ゲノム上のタンパク質に転写・翻訳される領域「エクソン」を限定的に回収し、シーケンス・解析する手法です。エクソンに対して特異的なプローブを用いることで、エクソン領域のみを回収してシーケンスを行います。

ホールゲノム解析と比べて取得データ量を抑えることで、低コストに解析できる点がメリットになります。ガン組織の解析などの厚みのあるデータが必要な場合に、有効な手法になります。

実施可能なアプリケーション例

ヒトエクソーム解析

Agilent technologies社のSureSelectを使用してライブラリ調製を行いシーケンスを実施します。

代表的な仕様

  • 使用キット:Agilent SureSelect Human v6(UTR 無し)
  • シーケンス条件:NovaSeq6000 150bp, paired end, 7 Gb /sample
  • データ解析:マッピング、SNP解析、small In/Del 解析

※V5, UTRあり、Mouse 等のキットの選択も可能です。

参考資料

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