製品・サービスに関するご相談・お問合わせ サンプル・デモ請求(ユーザー) サンプル・デモ請求(代理店) オリゴDNA合成DNAシーケンス
クイック検索

試薬・キット・消耗品
タンパク質
細胞溶解・タンパク質抽出
タンパク質サンプル調製
タンパク質定量
電気泳動
プロテオーム
ウェスタンブロッティング
細胞・組織
再生医療研究
免疫組織染色・ISH
遺伝子
PCR
核酸精製
遺伝子導入
電気泳動
ゲノム編集
タンパク質発現
その他
機器
消耗品

受託サービス
タンパク質
プロテオーム解析
抗体作製
ペプチド合成
組換えタンパク質の発現精製
タンパク質のX線結晶構造解析
糖鎖構造解析
遺伝子
次世代シーケンシング解析
マイクロアレイ解析
リアルタイムPCR
ゲノム編集ツール
遺伝子改変生物作製
DNAシーケンス
フラグメント解析
オリゴDNA合成
植物バイオ受託
細胞・組織
細胞試験
免疫組織染色・組織染色
in situ ハイブリダイゼーション
レーザーマイクロダイセクション
その他
メタボローム解析
ELISA測定
動物試験
動物の飼育・繁殖・管理
                アプロサイエンス採用情報
 
  1. HOME >
  2. 受託サービス >
  3. 次世代シーケンシング解析 >
  4. ゲノム解析

ゲノム変異解析(DNA-Seq, ホールゲノム解析)

ゲノム変異解析(DNA-Seq, ホールゲノム解析)
既知配列と比較して変異解析(SNPs、small Insertion/Deletion)を行います。

サービス概要

 次世代シーケンサーを用いて、ゲノム配列が既知である生物種(リファレンス配列のある生物種)についてゲノムDNAのシーケンスを行い、取得した配列情報を、既知のリファレンス配列に対してマッピングを行い、塩基の置換や逆位、SNPs、small Insertion/Deletion 等の変異解析を行います。
また、ヒトの場合は、SV(Structural Variant, 構造変異)、CNV(Copy Number Variation, コピー数変動)の解析も可能です。

ゲノムサイズに応じて、取得するデータ量を調整します。
基本的には、イルミナ社のショートリードのシーケンサーを利用します。

実施可能なアプリケーション例

ショットガン シーケンス(DNAシーケンス)


イルミナ社のショートリードのシーケンサー(HiSeq, NovaSeq6000など)を用いて、低コストに大量のデータを取得します。
取得データ量の目安は、ゲノムサイズの30倍程度になります。

<代表的な仕様>
 ライブラリ調製:TruSeq DNA PCR-Free もしくは TruSeq DNA nano Kit
 シーケンス条件:NovaSeq6000, 150bp, paired end, 数~数十Gb /sample
 データ解析  :マッピング、SNP解析、small In/Del 解析、CNV, SV
※ CNV, SVは、ヒトの場合のみの対応となります。








ページトップへ